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其余建制的部队，在辽西进一步整编，最终形成了约有七万四千人的野战部队。
锦州要塞三度被围之后，多尔衮在八月和九月连续发起了两次解围行动，这是因为，新进入要塞的一万七千人，全部是满洲八旗的精锐，而且两白旗的兵马都在其中，多尔衮承受不起失去这支军队的代价。
连续的解围行动，正中李肇基的下怀，让李肇基可以在辽西走廊的平坦地势下可以与清军进行决战。
第三次战役中，清军数次调遣兵马拉扯阵线，试图调动东方军团，但李肇基不为所动，双方伤亡都不大。
第四次战役，围绕大凌河堡，东方军团七万多人与清军八万多人进行了一天的决战，以清军承受不起伤亡，退到大凌河东岸而告终。
这两次解围失败，多尔衮被迫开始求援，对外藩蒙古进行最后一轮动员，完全放弃朝，鲜，把济尔哈朗所部调遣来辽西走廊。
希望再次取得对东方军团的优势之后，发起进攻。同时，多尔衮向大顺求援，明确表示，若不来援，满清会兵败覆灭。
显然，大顺不希望失去了一个牵扯东方商社的力量，在接到求援之后，一支军队立刻出山海关，让东方军团腹背受敌，但因为宁远要塞的存在，顺军也没有把握击穿辽西走廊。
但李肇基的战略目标达到了，顺军南方前线退兵，放弃了南下进攻大明的计划，只不过等湖广方向的大军抵达山海关，发起进攻，就又需要三个月的时间。
围绕锦州要塞，双方一直打到十一月大雪降临。第五次战役依旧发生在大凌河堡，多尔衮强迫顺治亲征，拉来满蒙汉鲜三十二旗，外藩蒙古和藩下军队、绿营，满清国内所有能拿的起长矛的人都参与了战斗，围绕大凌河堡进行了一系列的攻防。
但三天时间，也没有打破东方军团的防御，在十月二十日，李肇基亲自指挥的反击，击破了阿济格率领的右翼，阵斩阿济格，大破清军，斩首、俘虏六万有余，清军随即撤退，一路撤过了辽河。
第六次战役则是锦州要塞围城战，在长期的臼炮轰击下，锦州要塞几乎倾颓，守军死伤惨重，面对援军几次被打退，满达海选择了投降，自此，清军主力损失殆尽。
而远道而来，在山海关内集结的顺军得知消息，也不敢再有妄动。整个冬天，李肇基都与大顺、满清双方进行谈判。
李肇基分别联系的多尔衮和顺治，有些条件是一样的，比如交出东方商社叛徒刘利，交出汉奸吴三桂、孔有德、钱谦益等人。
但有些条件都不同，李肇基向多尔衮要顺治的脑袋，而向顺治要多尔衮的脑袋。
还向其他人同时索要多尔衮和顺治的脑袋。最终，在弘光十一年的除夕夜，在博洛的支持下，顺治率先发起了政，变，抓住了多铎和多尔衮，如果情况一切顺利，满清这一次的政，变只会造成权力转移，而不会有更大的损失。
但是，谁也没想到的是，参与政，变的阿巴泰发动了政，变之中的政，变，他已经认识到了满清必败，在政，变发起前，顺治就已经决定，不论胜败，满清都要向大顺称臣纳贡，逊位后请求庇护。
在阿巴泰看来，既然皇位都没有了，那么满清的权柄在谁手里不是呢？
他瞒着两个儿子，控制了盛京城，意图把八旗贵族一网打尽，但遭到了博洛的反抗，忠诚于顺治的力量与阿巴泰所部在盛京城里发生了血腥的内战，最终以东方军团近卫师的抵达而结束。
在大雪之中，博洛护送顺治等皇族出城逃亡草原，而阿巴泰则拿着多尔衮兄弟的人头向李肇基求和。
如此，整个辽东都落入了东方商社的手中。整个冬季，李肇基都在盛京一带，招抚百姓，安定地方。
本地的百姓，不分民族，全部被李肇基编为了军户，其中汉人十个万户，鲜人四个万户，蒙古两个万户，满洲三个万户。
李肇基让降将和有功之臣统帅这些个万户，在开春之后，首要的就是恢复生产。
开春之后，李肇基在海陆两军的拥护下，在已经改名为沈阳的盛京城称帝。
与大顺、大明之间的对立不同，两个朝廷不约而同的承认了李肇基的帝位，还纷纷要求成为兄弟之国。
从弘光十二年前，商社进入休养生息阶段，裁汰了很多陆军部队，把资源集中于海军方面，最终在弘光十五年，不宣而战，派遣铁甲舰队进入巴达维亚，击沉了荷兰人的大量舰船，正式对荷兰人宣战。
英国人、葡萄牙人相继加入，最终荷兰战败，出让了包括马六甲、锡兰、台湾等地的殖民地，保留了东方的存在。
而大顺也借机南下，在弘光十五年占领了江南、湖广，朱由崧退避广东。
只不过，海战胜利的很快，李肇基随即整编陆军，充实扩建了三个野战军，把陆战队编组了一个野战军，并且大规模组织原满清军队，合计二十万大军在弘光十七年越过边墙南下，夺取了天津卫，并且登陆胶州湾，占领了青岛，山海关已经失去了意义，李肇基率大军于京城之外与李自成决战，一举战胜。
只用了一年时间，就占领了中原和江南，然后驱虎吞狼，让大顺消灭了大明，朱由崧最终选择逊位，李肇基取而代之，统一全国。